Собственный опыт.
Регистрация через сайт "госуслуги" возможна, но оказалась сложнее, чем я думала. Для отправки документов в ИФНС нужно иметь квалифицированный сертификат ключа проверки электронной подписи и соответствующий ему ключ электронной подписи . Чтобы его получить нужно обратиться в специализированную организацию, которая выпускает сертификаты ключей и является аккредитованной Минкомсвязью России удостоверяющим центром. На мой взгляд - проще документы сдать в ИФНС вручную.
Но оказалось есть более быстрый и удобный вариант - на сайте nalog.ru. Там размещена информация для регистрации ИП: http://nalog.ru/rn77/ip/interest/reg_ip/petition/
Пошаговая инструкция по формированию заявления на сайте www.nalog.ru размещена здесь. Там же на сайте необходимо оплатить госпошлину 800 рублей через банки, аккредитованные на сайте. Так как моего банка в списке не было, я воспользовалась сервисом Кошелька Киви. Никакой комиссии с меня удержано не было.
После отправки заявления в регистрирующий орган в течение 3-х рабочих дней на электронный адрес придет сообщение о результатах рассмотрения. Ровно через 3 рабочих дня я получила сообщения о том, что мне необходимо в течение недели прийти в ИФНС № 46 и представить паспорт и его копию, квитанцию об оплате госпошлины, а также Заявление о переходе на упрощенную систему налогообложения, если я планирую ее применять. Заявление нужно распечатать в трех экземплярах.
В ИФНС № 46 при получении талона в терминале надо выбрать пункт "Интерактивное заявление". Очередь идет быстро - я ждала минут 10. Меня зарегистрировали в этот же день и вечером мне на электронный адрес пришла информация о присвоении государственного регистрационного номера (ОГРНИП).
Оригиналы получила на следующий день.
В итоге: В регистрирующий орган пришлось ездить дважды, как и при подаче документов в бумажном виде. Но сроки регистрации меньше - 3 рабочих дня, снижается риск отказа в регистрации, очередь в регистрирующем органе значительно короче.